查重作业市场正处于快速成长期，多种查重制度的出现是市场发展的必然趋势，让越来越多的人认识到学术道德建设的重要性，加强加强查重作业的原创性，减少剽窃，具有重要的现实意义。
据一位教师介绍，在调查过程中，查重技巧的出现，在很大程度上确实对规范学术起到了一定作用，至少对学术不端行为起到了一定的震慑作用。但通过技术查重手段防止学术不端毕竟是机器而非人，在对机械的判断情况下也存在着漏洞，具有一定的局限性，如下：
对个案讨论、问题例证、问卷调查、法条等某些内容的引用也会有抄袭嫌疑。这是写文章的常见行为，判断抄袭不太合理。文科生也会出现比较多的这种现象，这种现象导致了作者很难修改，所以只有修改才能修改。在这种情况下，防止学术不当成为应对学术不当行为的应对措施。
查重软件可以杜绝剽窃行为，但无法提高个人论文的质量。
很难用软件对论文质量进行评估。有的学生在答辩和提交查重时，论文是完全不同的文章，可能是一篇不相干的论文，这种回避查重的行为对提高论文质量根本起不到任何作用。其它如抄袭他人未发表的论文、内部小范围交流稿等，这些都很难发现，这种抄袭与自己的学术能力无关。
论文观点的抄袭软件是没有用的。
查重软件是机械地找出论文相似部分的内容，对于内容的观点、思想的剽窃还是处于无能为力的状态，通过变换语句、句式等来重新表达，查重系统是检测不到的，对于现在大学的指导老师来说，为了减少抄袭现象，必须花很多精力去检查学生的论文。
在当前众多的查重系统中，他们的目标只有一个，那就是端正学术行为。以科技手段防止和检查学术不端行为只是手段之一，若以科技手段达到警醒作用，逐渐形成良好的学术氛围，让同学们自律自己的学术研究，从这方面来说，才是论文查重软件存在的真正意义，也是政府和管理部门所希望看到的
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