总体上看，检测系统对论文格式没有什么要求，各校对论文格式的要求也各不相同，那么上传的格式是什么，系统会根据论文的格式来进行检查，只要我们严格按照学校的要求去调整论文格式，论文格式是不影响检查的。论文采用何种格式，查重系统将给出论文采用何种格式的查重率。
当然论文的基本格式还是要调整好的，比如论文中的目录、参考文献这类不参与查重的部分要体现在格式上，很多查重系统都能智能地区分这两个部分，在查重时不会对其进行重复性计算，如果没有标注参考文献，系统就会误判正文内容，造成重复性过高
但值得注意的是，无论查重对格式是否有要求，在提交给学校之前，都应严格按照学校的要求进行排版，学校对格式的要求是怎样的，如何调整，这样不但不会因格式原因而被退回，而且不会影响最终的查重结果。
毕业论文的格式不会在查重系统中造成很大影响，在系统中上传论文时，要注意文件的格式，只要文件格式没有错误，就可以成功提交，论文引用部分也要做好标记，系统基本不会对重复率进行误判。